Dokumentiranje človeških izgub, taborišč in drugih zaporniških objektov v vojnah devetdesetih na ozemlju bivše Jugoslavije je najpomembnejša podpora uresničitvi mandata REKOM-a.
Cilj dokumentiranja človeških izgub v vojnah na ozemlju bivše Jugoslavije je vzpostavitev zanesljive baze podatkov o človeških izgubah v zvezi z vojno na Kosovu in na Hrvaškem; o človeških izgubah Srbije in Črne Gore v vojni v BiH; objava online registra človeških izgub in objava Kosovske knjige spomina v obliki pripovedi o posamičnih žrtvah.
Cilj projekta Kartiranje taborišč v BiH je evidentiranje in dokumentiranje vseh zaporniških objektov, v katerih so bili zakonito zadrževani vojni ujetniki in nezakonito zapirane civilne osebe, in popis imen zapornikov, ki so bili ubiti ali so umrli pri opravljanju prisilnega dela, ki so bili podvrženi mučenju ali so bili nečloveško obravnavani.
